La Sede di coordinamento di Euromedcity è allocata presso la Sede centrale dell'Accademia del Mediterraneo e Maison de la Méditerranée, in Napoli alla Via Depretis n. 130

La Sede delle Capitali di Euromedcity sarà operativa nel Belvedere di San Leucio, resa disponibile dal Comune di Caserta, come annunciato il 17/10/2001 in un incontro presso la Regione Campania.

Le Sedi distaccate saranno operative presso le Città capofila per aree tematiche.